MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL02

Total Repeats: 6072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014825	TTTAGC	2	12	139	150	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319788692
2	NC_014825	CTG	2	6	155	160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788692
3	NC_014825	TCCC	2	8	250	257	0 %	25 %	0 %	75 %	319788692
4	NC_014825	TAT	2	6	295	300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319788692
5	NC_014825	GTG	2	6	327	332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319788692
6	NC_014825	ACA	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788692
7	NC_014825	TGA	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788692
8	NC_014825	CAGCGT	2	12	482	493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319788692
9	NC_014825	TA	3	6	499	504	50 %	50 %	0 %	0 %	319788692
10	NC_014825	A	7	7	517	523	100 %	0 %	0 %	0 %	319788692
11	NC_014825	TGA	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788692
12	NC_014825	TGA	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788692
13	NC_014825	AGGC	2	8	684	691	25 %	0 %	50 %	25 %	319788692
14	NC_014825	AAC	2	6	725	730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788692
15	NC_014825	TAG	2	6	738	743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788692
16	NC_014825	CTG	2	6	800	805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788692
17	NC_014825	GAC	2	6	848	853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788692
18	NC_014825	CCAC	2	8	867	874	25 %	0 %	0 %	75 %	319788692
19	NC_014825	GAG	2	6	887	892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788692
20	NC_014825	GCTGG	2	10	934	943	0 %	20 %	60 %	20 %	319788692
21	NC_014825	TGA	2	6	975	980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788692
22	NC_014825	AGAT	2	8	981	988	50 %	25 %	25 %	0 %	319788692
23	NC_014825	CAG	2	6	1070	1075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788692
24	NC_014825	TGT	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319788692
25	NC_014825	CTG	2	6	1109	1114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788692
26	NC_014825	CTG	2	6	1118	1123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788692
27	NC_014825	AGA	2	6	1194	1199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788692
28	NC_014825	GAG	2	6	1310	1315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788692
29	NC_014825	ACA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788692
30	NC_014825	CGCTG	2	10	1366	1375	0 %	20 %	40 %	40 %	319788692
31	NC_014825	CTA	2	6	1450	1455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788692
32	NC_014825	GAG	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788692
33	NC_014825	TTC	2	6	1520	1525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788692
34	NC_014825	ATG	2	6	1554	1559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788692
35	NC_014825	AAGA	2	8	1634	1641	75 %	0 %	25 %	0 %	319788692
36	NC_014825	GAT	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788693
37	NC_014825	GTCAG	2	10	1906	1915	20 %	20 %	40 %	20 %	319788693
38	NC_014825	AT	3	6	1957	1962	50 %	50 %	0 %	0 %	319788693
39	NC_014825	CTT	2	6	1973	1978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788693
40	NC_014825	AT	3	6	2008	2013	50 %	50 %	0 %	0 %	319788693
41	NC_014825	CTG	2	6	2061	2066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788693
42	NC_014825	ATA	2	6	2114	2119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319788693
43	NC_014825	GCT	2	6	2187	2192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788693
44	NC_014825	CA	3	6	2322	2327	50 %	0 %	0 %	50 %	319788693
45	NC_014825	CAA	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788694
46	NC_014825	TGTTCG	2	12	2586	2597	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319788694
47	NC_014825	GAAA	2	8	2700	2707	75 %	0 %	25 %	0 %	319788694
48	NC_014825	CAG	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788694
49	NC_014825	AGGC	2	8	2934	2941	25 %	0 %	50 %	25 %	319788694
50	NC_014825	GA	3	6	3127	3132	50 %	0 %	50 %	0 %	319788694
51	NC_014825	GAA	2	6	3148	3153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788694
52	NC_014825	C	6	6	3227	3232	0 %	0 %	0 %	100 %	319788694
53	NC_014825	GAA	2	6	3257	3262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788694
54	NC_014825	GAG	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788694
55	NC_014825	CGA	2	6	3361	3366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788694
56	NC_014825	AAC	2	6	3386	3391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788694
57	NC_014825	GTATGG	2	12	3497	3508	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	319788694
58	NC_014825	CA	3	6	3538	3543	50 %	0 %	0 %	50 %	319788694
59	NC_014825	ACT	2	6	3588	3593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788694
60	NC_014825	GCA	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788694
61	NC_014825	GCG	2	6	3609	3614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319788694
62	NC_014825	ATA	2	6	3636	3641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319788694
63	NC_014825	TA	3	6	3640	3645	50 %	50 %	0 %	0 %	319788694
64	NC_014825	CAG	2	6	3683	3688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788694
65	NC_014825	CAT	2	6	3742	3747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788694
66	NC_014825	ACC	2	6	3753	3758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319788694
67	NC_014825	CTG	2	6	3824	3829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788694
68	NC_014825	GTT	2	6	3950	3955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319788694
69	NC_014825	TCT	2	6	3964	3969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788694
70	NC_014825	ACA	2	6	3984	3989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788694
71	NC_014825	GTAC	2	8	3995	4002	25 %	25 %	25 %	25 %	319788694
72	NC_014825	CA	3	6	4015	4020	50 %	0 %	0 %	50 %	319788694
73	NC_014825	AC	3	6	4050	4055	50 %	0 %	0 %	50 %	319788694
74	NC_014825	CCA	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319788694
75	NC_014825	CGC	2	6	4261	4266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319788694
76	NC_014825	GAG	2	6	4331	4336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788694
77	NC_014825	ATA	2	6	4350	4355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319788694
78	NC_014825	CTT	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788694
79	NC_014825	TAA	2	6	4466	4471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319788694
80	NC_014825	CTTT	2	8	4558	4565	0 %	75 %	0 %	25 %	319788695
81	NC_014825	T	6	6	4563	4568	0 %	100 %	0 %	0 %	319788695
82	NC_014825	CAT	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788695
83	NC_014825	CAA	2	6	4610	4615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788695
84	NC_014825	GCC	2	6	4651	4656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319788695
85	NC_014825	CA	3	6	4690	4695	50 %	0 %	0 %	50 %	319788695
86	NC_014825	CCA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319788695
87	NC_014825	CCG	2	6	4717	4722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319788695
88	NC_014825	GCG	2	6	4794	4799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319788695
89	NC_014825	AT	3	6	4854	4859	50 %	50 %	0 %	0 %	319788695
90	NC_014825	ATC	2	6	4866	4871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788695
91	NC_014825	CAC	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319788695
92	NC_014825	CAT	2	6	4965	4970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788695
93	NC_014825	GGC	2	6	5010	5015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319788695
94	NC_014825	ATC	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788695
95	NC_014825	AAT	2	6	5082	5087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319788695
96	NC_014825	CTG	2	6	5113	5118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788695
97	NC_014825	GAA	2	6	5171	5176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788695
98	NC_014825	GTT	2	6	5191	5196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319788695
99	NC_014825	T	6	6	5232	5237	0 %	100 %	0 %	0 %	319788695
100	NC_014825	T	8	8	5240	5247	0 %	100 %	0 %	0 %	319788695
101	NC_014825	CAT	2	6	5254	5259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788696
102	NC_014825	TAA	2	6	5306	5311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319788696
103	NC_014825	TTC	2	6	5318	5323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788696
104	NC_014825	TAA	2	6	5337	5342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319788696
105	NC_014825	CGC	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319788696
106	NC_014825	TCC	2	6	5512	5517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319788697
107	NC_014825	ATT	2	6	5598	5603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319788697
108	NC_014825	TGA	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788697
109	NC_014825	TATC	2	8	5815	5822	25 %	50 %	0 %	25 %	319788697
110	NC_014825	CAG	2	6	5828	5833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788697
111	NC_014825	ATC	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788697
112	NC_014825	ATG	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788697
113	NC_014825	TAA	2	6	5970	5975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319788697
114	NC_014825	ATC	2	6	5990	5995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788697
115	NC_014825	AT	3	6	6085	6090	50 %	50 %	0 %	0 %	319788697
116	NC_014825	ACA	2	6	6159	6164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788697
117	NC_014825	CAG	2	6	6170	6175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788697
118	NC_014825	AAGA	2	8	6236	6243	75 %	0 %	25 %	0 %	319788697
119	NC_014825	CGC	2	6	6271	6276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319788697
120	NC_014825	AAT	2	6	6288	6293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319788697
121	NC_014825	CAGTA	2	10	6338	6347	40 %	20 %	20 %	20 %	319788697
122	NC_014825	T	6	6	6643	6648	0 %	100 %	0 %	0 %	319788698
123	NC_014825	TGA	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788698
124	NC_014825	GCTG	2	8	6815	6822	0 %	25 %	50 %	25 %	319788698
125	NC_014825	CTG	2	6	6824	6829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788698
126	NC_014825	CGG	2	6	6831	6836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319788698
127	NC_014825	ATT	2	6	6874	6879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319788698
128	NC_014825	AGC	2	6	6900	6905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788698
129	NC_014825	GCC	2	6	7000	7005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319788698
130	NC_014825	GCA	2	6	7033	7038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788698
131	NC_014825	GCG	2	6	7039	7044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319788698
132	NC_014825	TGC	2	6	7083	7088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788698
133	NC_014825	GCA	2	6	7147	7152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788698
134	NC_014825	TGC	2	6	7239	7244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788698
135	NC_014825	GAT	2	6	7251	7256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788698
136	NC_014825	TGA	2	6	7269	7274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788698
137	NC_014825	ATG	2	6	7345	7350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788698
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139	NC_014825	AG	3	6	7425	7430	50 %	0 %	50 %	0 %	319788699
140	NC_014825	TCG	2	6	7474	7479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788699
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143	NC_014825	TCG	2	6	7600	7605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319788699
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145	NC_014825	TACCAT	2	12	7755	7766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788699
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152	NC_014825	GTA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788699
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156	NC_014825	TCT	2	6	8417	8422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319788699
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244	NC_014825	A	7	7	13284	13290	100 %	0 %	0 %	0 %	319788703
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248	NC_014825	A	6	6	13424	13429	100 %	0 %	0 %	0 %	319788703
249	NC_014825	AGG	2	6	13436	13441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319788703
250	NC_014825	TAT	2	6	13478	13483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319788703
251	NC_014825	GCG	2	6	13520	13525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319788704
252	NC_014825	GAA	2	6	13526	13531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319788704
253	NC_014825	ATA	2	6	13589	13594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319788704
254	NC_014825	AAGA	2	8	13612	13619	75 %	0 %	25 %	0 %	319788704
255	NC_014825	ACA	2	6	13638	13643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788704
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257	NC_014825	ATC	2	6	13735	13740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319788704
258	NC_014825	GTT	2	6	13763	13768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319788704
259	NC_014825	ACA	2	6	13772	13777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319788704
260	NC_014825	GAT	2	6	13844	13849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319788704
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262	NC_014825	AAAG	2	8	13867	13874	75 %	0 %	25 %	0 %	319788704
263	NC_014825	CAG	2	6	13882	13887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319788704
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